高能電子加速器在食品輻照加工中的應用與鈷60-γ射線基本相同，主要有以下幾方面：
1、抑制生理生長，延長貨架期。如大批量輻照大蒜，抑制其生理生長，達到保鮮目的。輻照新鮮水果、蔬菜，抑制酶活動，推遲成熟、延長貨架期。
2、殺蟲滅菌作用。如殺滅谷類中的害蟲，調味品、脫水蔬菜中的細菌，食品中的食源性致病菌等。
3、冷凍畜禽肉類海產品的保鮮。高能加速器電子束的能量高，處理速度快，適宜于需及時輻照處理的冷凍食品。
4、降解和破壞食品中的有害殘留物及食品過敏原。
5、進出口的輻照檢疫處理。
王殿軒等采用電子束輻照處理米象Sitophilus oryzae(I innaeus)成蟲，研究在不同輻照劑量的處理后害蟲體內脂酸及相對含量變化。米象蟲體內不同種類的脂肪酸受電子束輻照的影響程度存在差異。
徐朝哲等對ESS－010－03電子直線加速器輻照處理水果中的檢疫性害蟲的適用性進行了研究，確定用400Gy的處理劑量能夠有效殺滅水果中的橘小實蠅2－3齡幼蟲，并對經過處理的13種水果的多項理化指標及風味檢測研究證明，400Gy的處理劑量不會對水果產生不良影響。
